国立台湾大学医学系张哲睿
台北市立建国高中刘翠华教师
主要组织相容性复合物（major histocompatibility complex，MHC）是一种细胞表面糖蛋白复合物，人类的MHC 糖蛋白，又称为人类白血球抗原群（human leukocyte antigens，HLA），最初是因为研究皮肤的移植和排斥反应被发现。
人类的MHC 蛋白可以分为两大类：第一型MHC 分子（class I MHC）和第二型MHC 分子（class II MHC），前者位于个体中所有有核的细胞上，后者则只分布在抗原呈现细胞（antigen-presenting cell，APC）上，例如巨噬细胞（macrophage）、B 细胞、树突细胞（dendritic cell）等。
高中课程中提及，第一型MHC 分子使得被感染的一般细胞能将抗原呈现给胞杀T 细胞（cytotoxic T cell，Tc），让细胞媒介型免疫反应（cell-mediated immune response）能正常运作；而第二型MHC 分子则使得抗原呈现细胞能将抗原呈现给辅助型T 细胞（helper T cell，TH）。但上述的过程究竟是如何发生的呢？以下分述第一型 MHC 分子和第二型 MHC 分子的运作机转。
就第一型MHC 分子的运作来说，在细胞质中的蛋白酶体（proteasome）会将细胞质中无论是自己的或外来的蛋白质都降解为胜肽，而这些被降解的胜肽会被内质网上的抗原加工相关性传递蛋白（transporter associated with antigen processing，TAP）运送到内质网腔，再和内质网中尚未加工完毕的第一型MHC 分子结合，并与之一同被运送到细胞膜上。从生物化学的角度来看，由于每种MHC 分子只会依靠被结合的胜肽链上的2 个胺基酸就能与之稳定结合，因此一种MHC 分子就能结合数以百万计的胜肽。
至于第二型 MHC 分子，和它结合的胜肽并不是来自于细胞质，而是来自于胞吞作用（endocytosis）后摄入再被降解的蛋白质。当第二型MHC 分子仍在内质网组装时，其与胜肽结合的沟槽会先被自身的胜肽链阻挡住，防止其与内生的蛋白质或来自细胞质降解的蛋白质结合；而当其被运送到高基氏体，并与来自溶体装有降解后蛋白质的囊泡结合后，其原先阻挡沟槽的胜肽部分才会被切除。
这样的机转使得第一型MHC 分子和第二型MHC 分子的来源蛋白是分离的，使两类MHC 分子的抗原呈现能代表不同的讯息：第一型MHC 分子传递的是「我被感染了」的讯号，让免疫系统能摧毁被感染的细胞；而第二型MHC 分子传递的是「我周遭遇到敌人了」的讯号，让免疫系统能整个活化，摧毁外来物。
从族群遗传学的角度来看，MHC 蛋白是已知型态最多样化的蛋白质。几乎所有人的 MHC 基因都是异型组合（heterozygous），除非是同卵双生子，几乎不可能找到具有完全相同之 MHC 基因的两个人。这样的多型性可以确保无论遇到怎样的疾病，总会有一部份的个体能对病原进行有效的免疫反应，因而能确保族群的延续。